Naslov PROTEOMSKA ANALIZA EPITELNOGA I VEZIVNOGA TKIVA PARODONTA KOD PACIJENATA S AGRESIVNIM PARODONTITISOM
Naslov (engleski) PROTEOMIC ANALYSIS OF THE EPITHELIAL AND CONNECTIVE PERIODONTAL TISSUE IN PATIENTS WITH AGGRESSIVE PERIODONTITIS
Autor Ana Badovinac
Mentor Darko Božić (mentor)
Mentor Lovorka Grgurević (komentor)
Član povjerenstva Darije Plančak (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstva Andrej Aurer (član povjerenstva)
Član povjerenstva Marinka Mravak-Stipetić (član povjerenstva)
Član povjerenstva Marija Ivić (član povjerenstva)
Član povjerenstva Fran Borovečki (član povjerenstva) MBZ: 230266
Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj Sveučilište u Zagrebu Stomatološki fakultet (Zavod za parodontologiju) Zagreb
Datum i država obrane 2013-10-23, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana BIOMEDICINA I ZDRAVSTVO Dentalna medicina Parodontologija
Univerzalna decimalna klasifikacija (UDC ) 616.31 PRIMIJENJENE ZNANOSTI. MEDICINA. TEHNIKA. TEHNOLOGIJA Stomatologija
Sažetak Proteomske analize omogućuju iscrpan prikaz ekspresije proteina u različitim biološkim
uzorcima te predstavljaju napredan pristup u istraživanjima proteoma. Svrha ovog istraživanja
bila je dokazati da epitelno i vezivno tkivo parodonta zdravih ispitanika (kontrolna skupina) i
zdravog mjesta, mjesta s gingivitisom, parodontitisom i mjesta s parodontitisom nakon
terapije kod pacijenata s generaliziranim agresivnim parodontitisom (ispitivane skupine)
pokazuju različitu ekspresiju proteina.
U istraživanju je sudjelovalo osam pacijenata. Ispitivanu skupinu činila su četiri pacijenta s
dijagnozom generaliziranog agresivnog parodontitisa (dva muškarca i dvije žene), dok su
kontrolnu skupinu činila četiri ispitanika bez znakova parodontne bolesti kojima je razlog
dolaska bio kirurško produljenje krune zuba (dva muškarca i dvije žene). Uzorci epitelnog i
vezivnog parodontnog tkiva uzeti su pri provođenju inicijalne parodontološke terapije u
ispitivanoj skupini, a u kontrolnoj skupini tijekom indiciranog kirurškog zahvata. Uzorci su
pohranjeni u RNAlater tekućinu prema uputama proizvođača do analiza. Proteini tkivnog
lizata razdvojeni su 1D gel elektroforezom nakon koje je uslijedila digestija u gelu tripsinom
te mjerenje proteina pomoću nano-skale HPLC sistema preko nano-elektrospreja
ionizacijskog izvora i spektrometra mase. Dobiveni podaci obrađeni su u MaxQuant
programu.
Ukupan broj identificiranih proteina u istraživanju iznosio je 3420. Nakon statističke obrade
podataka izdvojena su 193 proteina koji su identificirani i kvantificirani u svim uzorcima, te
su u svim ispitivanim skupinama pokazali statistički značajnu promjenu ekspresije u odnosu
na kontrolnu skupinu. Proteini koji bi mogli biti obilježje zdravog parodonta jesu:
Multimerin-1, aneksini, 14-3-3 protein gamma; gingivitisa: Dedicator of cytokinesis protein
2, Band 3 anion transport protein; parodontitisa: Azurocidin, Myeloid cell nuclear
differentiation antigen, histoni, imunoglobulini, Prolargin; stanja poslije terapije:
Oligosaccharyltransferase complex subunit i Mimecan. Najzanimljiviji protein istraživanja je
Azurocidin koji pokazuje jaku ekspresiju u gingivitisu i parodontitisu. Rezultati istraživanja
pokazali su različitu ekspresiju proteina u ispitivanim skupinama te potvrdili da bi proteomske
analize parodontnog tkiva mogle pridonijeti boljem razumijevanju patogeneze parodontnih
bolesti, možda čak i napretku u dijagnostici i prognozi ovih bolesti.
Sažetak (engleski) Proteomic analyses enable large scale descriptions of protein expression in a variety of
biological samples, and provide an advanced approach in proteome research. The aim of this
study was to establish the changes in protein expression between the epithelial and connective
periodontal tissues samples in healthy subjects (control group) and healthy sites, sites with
gingivitis, periodontitis, and post treatment sites in patients suffering from generalized
aggressive periodontitis (test groups).
The study was conducted on eight patients divided into two groups. The test group consisted
of four patients with generalized aggressive periodontitis (two male, two female), and the
control group consisted of four subjects (two male, two female) with no signs of periodontal
disease, referred to the Department of Periodontology for crown lengthening procedure. The
epithelial and connective periodontal tissue samples in the test group were harvested during
initial periodontal treatment, and in the control group during the surgical procedure. Tissue
samples were stored in the RNAlater reagent according to the manufacturer’s instructions
until further analyses. Proteins from tissue lysate were separated by 1D gel electrophoresis, in
gel digested with trypsin, and measured by nano-scale HPLC system coupled to a mass
spectrometer through a nano-electrospray ionization source. The obtained raw data was
processed by MaxQuant software.
A total number of proteins identified in the study was 3420. After statistical processing of
data, a total of 193 proteins were identified and quantified in all samples, and showed
statistically significant changes in expression level between the control group and test groups.
Proteins that could possibly be a mark of periodontal health are: Multimerin-1, annexins, 14-
3-3 protein gamma; of gingivitis: Dedicator of cytokinesis protein 2, Band 3 anion transport
protein; of parodontitis: Azurocidin, Myeloid cell nuclear differentiation antigen, histones,
immunoglobulins, Prolargin; and of post treatment condition: Oligosaccharyltransferase
complex subunit and Mimecan. The most interesting protein in the study was Azurocidin,
showing the highest fold change in periodontitis and gingivitis. The results showed different
protein expressions in tested groups and confirmed that proteomic analyses of periodontal
tissue could contribute to a better understanding of the pathogenesis of periodontal diseases,
and might even contribute to the improvements in diagnosis and prognosis of these diseases.
Ključne riječi
agresivni parodontitis
gingivitis
proteomika
spektrometrija mase
biopsija
identifikacija proteina
proteini
Ključne riječi (engleski)
aggressive periodontitis
gingivitis
proteomics
mass spectrometry
biopsy
protein identification
proteins
Jezik hrvatski
URN:NBN urn:nbn:hr:127:469233
Studijski program Naziv: Dentalna medicina Vrsta studija: sveučilišni Stupanj studija: poslijediplomski doktorski Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje biomedicine i zdravstvo, polje dentalna medicina (dr.sc.)
Vrsta resursa Tekst
Način izrade datoteke Izvorno digitalna
Prava pristupa Otvoreni pristup
Uvjeti korištenja
Repozitorij Repozitorij Stomatološkog fakulteta u Zagrebu
Datum i vrijeme pohrane 2017-03-10 11:27:59