prikaz prve stranice dokumenta Identification and characterization of transposable elements in sponges (Porifera)
  Preuzmi
PDF 4.4 MB
disertacija
Identification and characterization of transposable elements in sponges (Porifera)
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2020. urn:nbn:hr:217:082440
Kuzman, Maja
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Citirajte ovaj rad

Kuzman, M. (2020). Identification and characterization of transposable elements in sponges (Porifera) (Disertacija). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:082440

Kuzman, Maja. "Identification and characterization of transposable elements in sponges (Porifera)." Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2020. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:082440

Kuzman, Maja. "Identification and characterization of transposable elements in sponges (Porifera)." Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2020. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:082440

Kuzman, M. (2020). 'Identification and characterization of transposable elements in sponges (Porifera)', Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 19.04.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:082440

Kuzman M. Identification and characterization of transposable elements in sponges (Porifera) [Disertacija]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2020 [pristupljeno 19.04.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:082440

M. Kuzman, "Identification and characterization of transposable elements in sponges (Porifera)", Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2020. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:082440

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:082440
Prijavite se u repozitorij kako biste mogli spremiti objekt u svoju listu.
Podaci o radu
NaslovIdentification and characterization of transposable elements in sponges (Porifera)
Naslov (engleski)Identifikacija i karakterizacija pokretnih genetičkih elemenata u spužvama (Porifera)
AutorMaja Kuzman
MentorKristian Vlahoviček (mentor)
Član povjerenstvaHelena Ćetković (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaRosa Karlić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2020-09-29, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Univerzalna decimalna klasifikacija
(UDC)		57 - Biološke znanosti. Fizička antropologija. Bioraznolikost
Sažetak
Transposable elements constitute a large portion of most eukaryotic genomes and play an important role in transcriptional regulation, shaping gene regulatory networks and genome evolution. Due to a lack of quality genome assemblies of non-model organisms, not much is known about the diversity, distribution and the role of transposable elements across Metazoa. In this thesis I present high quality genome assemblies for the sponge species Eunapius subterraneus and Suberites domuncula. I use computational genomics techniques to identify, characterize and compare transposable elements in the publicly available sponge genomes and in-house assembled genomes by analysing the abundance and conservation of the transposable elements in different sponge species. I assess the impact of transposable elements on the evolution of the host genomes by analysing their contribution to genome organization and correlation with gene expression. Finally, I present a catalog of the homologs of piRNA pathway in sponges and analyse their transcriptional activity.
Sažetak (engleski)
Prijenosni genetički elementi (transpozoni) sačinjavaju velik dio većine eukariotskih genoma i igraju važnu ulogu u regulaciji transkripcije, oblikovanju regulatornih mreža gena i evoluciji genoma. Zbog nedostatka kvalitetno sklopljenih genoma ne-modelnih organizama, ne zna se mnogo o raznolikosti, rasprostranjenosti i ulozi transpozona u skupini Metazoa. U ovom radu predstavljam visokokvalitetne sklopove genoma za vrste spužva Eunapius subterraneus i Suberites domuncula. Korištenjem tehnika računalne genomike identificiram, karakteriziram i uspoređujem pokretne elemente u javno dostupnim genomima spužvi i interno skupljenim genomima analizom brojnosti i očuvanja transpozona u različitim vrstama spužvi. Procjenjujem utjecaj transpozona na evoluciju genoma domaćina analizom njihovog doprinosa u organizaciji genoma i povezanosti s ekspresijom gena. Na kraju predstavljam katalog homologa piRNA puta u spužvama i analiziram njihovu transkripcijsku aktivnost.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:082440
Datum promocije2020
Studijski programNaziv: Biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: poslijediplomski doktorski
Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje biologija (dr.sc.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
RepozitorijRepozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta
Datum i vrijeme pohrane2020-10-27 10:06:33

(©) Nacionalna i sveučilišna knjižnica u Zagrebu 2015. Sva prava pridržana. | Hrvatske bratske zajednice 4 p.p. 550, 10000 Zagreb, Hrvatska Tel. ++ 385 1 616-4040
OIB: 84838770814 | IBAN: HR66 2340 0091 1000 1008 1, Porezni broj (PDV identifikacijski broj) - VAT Number: HR84838770814
Prijava u repozitorij