prikaz prve stranice dokumenta Mehanizmi regulacije sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli
Rad dostupan nakon 2025-01-27
disertacija
Mehanizmi regulacije sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. urn:nbn:hr:217:557423
Mitić, Damjan
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Citirajte ovaj rad

Mitić, D. (2023). Mehanizmi regulacije sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli (Disertacija). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:557423

Mitić, Damjan. "Mehanizmi regulacije sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli." Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:557423

Mitić, Damjan. "Mehanizmi regulacije sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli." Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:557423

Mitić, D. (2023). 'Mehanizmi regulacije sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli', Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 19.04.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:557423

Mitić D. Mehanizmi regulacije sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli [Disertacija]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2023 [pristupljeno 19.04.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:557423

D. Mitić, "Mehanizmi regulacije sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli", Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2023. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:557423

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:557423
Prijavite se u repozitorij kako biste mogli spremiti objekt u svoju listu.
Podaci o radu
NaslovMehanizmi regulacije sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli
Naslov (engleski)Mechanisms regulating the CRISPR-Cas system in Escherichia coli
AutorDamjan Mitić
MentorIvana Ivančić Baće (mentor)
Član povjerenstvaNenad Malenica (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaDavor Zahradka (član povjerenstva)
Član povjerenstvaDušica Vujaklija (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2023-01-27, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Univerzalna decimalna klasifikacija
(UDC)		577 - Biokemija. Molekularna biologija. Biofizika
Sažetak
Sustav CRISPR-Cas je adaptivni imunosni sustav za obranu prokariota od stranih genetičkih elemenata. Regulacija sustava CRISPR-Cas u bakteriji E. coli je kompleksna i nije u potpunosti razjašnjena. Poznato je da protein H-NS djeluje na razini transkripcije, šaperon HtpG na razini post-translacije, dok temperatura utječe na aktivnost proteina Cas3 na nepoznati način. U ovom radu su detaljnije istraženi mehanizmi regulacije aktivnosti sustava CRISPR-Cas na razini transkripcije i post-translacije. Praćenjem otpornosti stanica na infekciju fagom λvir i određivanjem količine transkripata gena cas utvrđeno je da protein StpA može inhibirati promotore Pcas8e i anti-Pcas u nedostatku proteina H-NS, te da pojačana ekspresija ili inaktivacija proteaze Lon u mutantu hns aktivira zaštitu od infekcije neovisno o sustavu CRISPR-Cas. Na aktivnost proteina Cas3 utječe ''anti-sense'' mRNA na nepoznat način, dok temperatura uzrokuje alosteričku promjenu konformacije ovog proteina čime se inhibira njegova nukleazna aktivnost. Šaperon HtpG nije utjecao na količine proteina Cas3, već vjerojatno na zauzimanje njegove pravilne konformacije.
Sažetak (engleski)
The CRISPR-Cas system is a prokaryotic adaptive immune system that provides defense against foreign DNA. The regulation of the CRISPR-Cas system in E. coli is complex and not fully understood. The repressor H-NS acts at the transcriptional level, HtpG posttranslationally, while the activity of Cas3 is affected by temperature in an unknown way. The aim of this research was to further elucidate the mechanisms regulating the activity of the CRISPR-Cas system at the transcriptional and post-translational level. Phage sensitivity assays and quantification of cas transcripts showed that StpA can inhibit Pcas8e and anti-Pcas promoters in the absence of H-NS. Overexpression or inactivation of Lon protease in hns mutants provides protection against phage infection independent of CRISPR-Cas. Cas3 protein activity is affected by an "anti-sense" mRNA in an unknown way, while allosteric change in Cas3 structure by temperature inhibits its nuclease activity. HtpG did not affect Cas3 levels, but the acquisition of the correct conformation.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:557423
Datum promocije2023
Studijski programNaziv: Biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: poslijediplomski doktorski
Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje biologija (dr.sc.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaRad dostupan nakon
Datum isteka embarga: 2025-01-27
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
RepozitorijRepozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta
Datum i vrijeme pohrane2023-02-02 10:26:08

(©) Nacionalna i sveučilišna knjižnica u Zagrebu 2015. Sva prava pridržana. | Hrvatske bratske zajednice 4 p.p. 550, 10000 Zagreb, Hrvatska Tel. ++ 385 1 616-4040
OIB: 84838770814 | IBAN: HR66 2340 0091 1000 1008 1, Porezni broj (PDV identifikacijski broj) - VAT Number: HR84838770814
Prijava u repozitorij