disertacija
Pojavnost viroza u autohtonim kultivarima vinove loze u hercegovačkomu vinogorju

Ana Karačić (2015)
Sveučilište u Zagrebu
Agronomski fakultet
Podaci o radu
NaslovPojavnost viroza u autohtonim kultivarima vinove loze u hercegovačkomu vinogorju
AutorAna Karačić
Voditelj/MentorEdyta Đermić
Sažetak rada
Vinova loza važna je kultura kojoj infektivne bolesti virusne prirode mogu drastično skratiti razdoblje eksploatacije. Najvažnija je strateška metoda u kontroli virusnih bolesti vinove loze preventiva i provodi se korištenjem certificirana sadnog materijala pri podizanju novih vinograda. Da bi se uspješno kontroliralo rasprostranjivanje viroza, neophodno je provođenje specifičnih i pouzdanih dijagnostičkih metoda: enzimski imunotest na čvrstoj fazi (ELISA) i reverzna transkripcija uz lančanu reakciju polimeraze (RT-PCR). Primjenom navedenih dijagnostičkih metoda na ukupno 1332 testiranih trsova dobiven je uvid u pojavnost devet virusa na šest ekonomski najvažnijih autohtonih kultivara u hercegovačkim vinogorjima. U šest autohtonih kultivara serološkim metodama detektirani su: Grapevine leafroll-associated virus-3 (GLRaV-3) u 884 trsova (66,3 %), Grapevine fanleaf virus (GFLV) u 500 trsova (37,5 %), Grapevine leafroll-associated virus-1 (GLRaV-1) u 293 trsova (22,0 %), Grapevine fleck virus (GFkV) u 197 trsova (14,7 %), Grapevine leafrollassociated virus-4-9 (GLRaV-4-9) u 90 trsova (6,7 %), Arabis mosaic virus (ArMV) u 17 trsova (1,2 %), Grapevine leafroll-associated virus-2 (GLRaV-2) u 3 trsa (0,2 %), dok virusi: Grapevine virus A (GVA) i Grapevine virus B (GVB) nisu detektirani. Od svih je testiranih Vinova loza važna je kultura kojoj infektivne bolesti virusne prirode mogu drastično skratiti razdoblje eksploatacije. Najvažnija je strateška metoda u kontroli virusnih bolesti vinove loze preventiva i provodi se korištenjem certificirana sadnog materijala pri podizanju novih vinograda. Da bi se uspješno kontroliralo rasprostranjivanje viroza, neophodno je provođenje specifičnih i pouzdanih dijagnostičkih metoda: enzimski imunotest na čvrstoj fazi (ELISA) i reverzna transkripcija uz lančanu reakciju polimeraze (RT-PCR). Primjenom navedenih dijagnostičkih metoda na ukupno 1332 testiranih trsova dobiven je uvid u pojavnost devet virusa na šest ekonomski najvažnijih autohtonih kultivara u hercegovačkim vinogorjima. U šest autohtonih kultivara serološkim metodama detektirani su: Grapevine leafroll-associated virus-3 (GLRaV-3) u 884 trsova (66,3 %), Grapevine fanleaf virus (GFLV) u 500 trsova (37,5 %), Grapevine leafroll-associated virus-1 (GLRaV-1) u 293 trsova (22,0 %), Grapevine fleck virus (GFkV) u 197 trsova (14,7 %), Grapevine leafrollassociated virus-4-9 (GLRaV-4-9) u 90 trsova (6,7 %), Arabis mosaic virus (ArMV) u 17 trsova (1,2 %), Grapevine leafroll-associated virus-2 (GLRaV-2) u 3 trsa (0,2 %), dok virusi: Grapevine virus A (GVA) i Grapevine virus B (GVB) nisu detektirani. Od svih je testiranih trsova, 1153 (86,5 %) uzoraka nosilo barem jedan virus, dok je 179 (13,4 %) uzorka bilo zdravo, bez prisustva testiranih virusa. Zdravi trsovi predloženi su kao potencijalne biljke kandidati za proizvodnju sadnoga materijala ‘testiranog na viruse’. Analizom rezultata virusnih infekcija utvrđeno je da je 546 (40,9 %) uzoraka zaraženo samo s jednim virusom, 423 (31,7 %) s dva, 155 (11,6 %) s tri, 28 (2,1 %) s četiri, 3 (0,2 %) s pet što je ujedno i najveći broj analizom utvrđenih kombinacija. Od 90 uzoraka koji su serološki bili pozitivni na grupu virusa GLRaV-4-9 (GLRaV-4, -5, -6, -7, -9), izabrano je njih 27 kod kojih je metodom RT-PCR i korištenjem para početnica utvrđena prisutnost GLRaV-5 kod šest uzoraka kao i GLRaV-9 kod sedam uzoraka. Ostali virusi iz grupe GLRaV-4-9 nisu registrirani. Prisutnost GLRaV-2 u uzorku, u kojem je metodom ELISA detektiran, uspješno je potvrđena primjenom metode RT-PCR uz korištenje GLR2CP1/GLR2CP2 para početnica. Tijekom dvije vegetacijske sezone (2011/12 i 2012/13) vršeno je vizualno praćenje analiziranih trsova. Dominantni simptomi na šest autohtonih kultivara bili su: zastoj u kretanju vegetacije, skraćeni internodiji, različiti poremećaji u rastu i razvoju, uvijenost lišća, nejednolično odrvenjavanje i dozrijevanje grozdova, rehuljavost. Prema raspoloživim saznanjima, provedeno istraživanje predstavlja prvi nalaz GLRaV-2, GLRaV-5 i GLRaV-9 u Bosni i Hercegovini potvrđen molekularnim metodama, dok GFkV, GLRaV-2 i grupa virusa GLRaV-4-9 predstavlja prvi nalaz u Bosni i Hercegovini potvrđen serološkim metodama.
Ključne riječivinova loza autohtoni kultivari detekcija ELISA RT-PCR
Naslov na drugom jeziku (engleski)Incidence of viroses in autochthonous grapevine cultivars in Herzegovina vineyards
Povjerenstvo za obranuEdi Maletić (predsjednik povjerenstva)
Marko Ivanković (član povjerenstva)
Dijana Škorić (član povjerenstva)
Ivan Pejić (član povjerenstva)
Mirna Ćurković-Perica (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila akademski/stručni stupanjSveučilište u Zagrebu
Agronomski fakultet
MjestoZagreb
Država obraneHrvatska
Znanstveno područje, polje, granaBIOTEHNIČKE ZNANOSTI
Poljoprivreda (agronomija)
UDK631/632
PRIMIJENJENE ZNANOSTI. MEDICINA. TEHNIKA. TEHNOLOGIJA
Poljoprivreda. Biljne bolesti. Zaštita biljaka
Vrsta studijasveučilišni
Stupanjposlijediplomski doktorski
Naziv studijskog programaPoljoprivredne znanosti
Akademski / stručni nazivdoktor/doktorica znanosti, područje biotehničkih znanosti, polje poljoprivreda
Kratica akademskog / stručnog nazivadr. sc.
Vrsta radadisertacija
Jezik hrvatski
Datum obrane2015-12-11
Sažetak rada na drugom jeziku (engleski)
Grapevine is an important species in which infectious diseases caused by viruses can drastically reduce the period of exploitation. The most important control strategy of grapevine viroses is prevention and consists of the use of certified planting materials in the establishment of new vineyards. In order to successfully control the virus spread, the implementation of specific and reliable diagnostic methods is essential: enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and reverse transcription and polymerase chain reaction (RTPCR). Using the above mentioned diagnostic techniques from the total number 1332 grapevine, an insight into the incidence of nine viruses in the six most important autochthonous cultivars grown in Herzegovina was gained. In the six autochthonous cultivars, using serological methods, the following viruses were detected: Grapevine leafroll-associated virus-3 (GLRaV-3) - in 884 grapevines (66,3 %), Grapevine fanleaf virus (GFLV) - in 500 grapevines (37,5%), Grapevine leafroll-associated virus-1 (GLRaV-1) - in 293 grapevines (22,0%), Grapevine fleck virus (GFkV) - in 197 grapevines (14,7 %), Grapevine leafrollassociated virus-4-9 (GLRaV-4-9) - in 90 grapevines (6,7 %), Arabis mosaic virus (ArMV) - in 17 grapevines (1,2%), Grapevine leafroll-associated virus-2 (GLRaV-2) - in 3 grapevines (0,2 %), while viruses Grapevine virus A (GVA) and Grapevine virus B (GVB) were not detected. Of all tested grapevines, 86,5 % specimens (1153 grapevines) had at least one virus, while 13,4 % specimens (179 grapevines) was free of tested viruses. The virus-free grapevines are proposed as a potential candidate plants for production of virus-tested planting material. The analysis of results showed that 546 grapevines (40,9%) were infected by only one virus, 423 (31,7 %) by two, 155 (11,6 %) by three, 28 (2,1 %) by four, 3 (0,2 %) by five, which presented the highest number of viruses in mixed infections. From 90 specimens positive on GLRaV-4-9 (GLRaV -4, -5, -6, -7, -9) viruses, 27 are chosen, and, by using RTPCR method employing pair of primers, the presence of GLRaV-5 in 6 specimens and GLRaV-9 in 7 specimens is detected. The other viruses belonging to GLRaV-4-9 group were not detected. The presence of GLRaV-2 in ELISA positive specimen is successfully confirmed using RT-PCR method with the use of GLR2CP1/ GLR2CP2 pair of primers. During two vegetation seasons (2011/12, 2012/13) visual observation of analysed grapevines was carried out. The dominant symptoms on 6 autochthonous cultivars: delayed start vegetation., reduced internodes, different disturbances in growth and development, leafroll, irregular lignification and ripening of grapes and, poor fruit set. According to our knowledge, this is the first report of GLRaV-2, GLRaV-5 and GLRaV-9 in Bosnia and Herzegovina on the genome (nucleic acids) based methods, and GFkV, GLRaV-2 and group of GLRaV-4-9 associated viruses on the basis of serological methods.
Ključne riječi na drugom jeziku (engleski)grapevine autochthonous cultivars detection ELISA Enzyme Linked Immunosorbent Assays RT-PCR
Verzijaobranjena verzija
Vrsta resursatekst
Prava pristupaRad dostupan samo djelatnicima i studentima matične ustanove
Uvjeti korištenja radahttp://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/
URN:NBNhttps://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:792684
PohranioVanja Masnov